More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1982 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1982  sensor histidine kinase, putative  100 
 
 		 344 aa  713    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  68.9 
 
 		 344 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  68.9 
 
 		 344 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  36.12 
 
 		 497 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  38.31 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 490 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1744  histidine kinase  37.56 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376505  normal  0.0197179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 1229 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 1101 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 1226 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  33.61 
 
 		 482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.98 
 
 		 489 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  27.95 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  33.49 
 
 		 783 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 700 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  31.68 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  31.68 
 
 		 492 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  31.68 
 
 		 492 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  31.68 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  31.68 
 
 		 492 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  31.68 
 
 		 492 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 492 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  35.75 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  34.93 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  32.48 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 779 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  29.76 
 
 		 451 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  30.54 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.73 
 
 		 456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  31.02 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  33.01 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 770 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 695 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 1046 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  30.92 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  25.13 
 
 		 830 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  33.04 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  30.96 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  32.76 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.07 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 700 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 509 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  32.08 
 
 		 772 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 691 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  35.05 
 
 		 710 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  28.31 
 
 		 640 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  35.05 
 
 		 710 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 598 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.03 
 
 		 1739 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 595 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 469 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  30.88 
 
 		 598 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 447 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 596 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  30.73 
 
 		 740 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 775 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 521 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  26.59 
 
 		 518 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 640 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 535 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  30.23 
 
 		 662 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.24 
 
 		 575 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 575 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  33.94 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 662 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  30.24 
 
 		 575 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 545 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  32.86 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 446 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 688 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  24.79 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 692 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 771 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 594 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 448 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 707 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  34.78 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 684 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 484 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 446 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  28.77 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  29.76 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>