252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1339 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  100 
 
 		 117 aa  231  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1871  camphor resistance CrcB protein  55.56 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1836  camphor resistance CrcB protein  55.56 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.5 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  46.59 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  37.39 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  37.39 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.67 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  43.33 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.64 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.88 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  34.48 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  40.24 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  42.39 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  34.75 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.89 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  33.91 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  37.65 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  43.53 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  35.4 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  35.65 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  42.22 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  44.71 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  36.17 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  41.38 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  41.11 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  42.17 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  33.72 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  31.58 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  30.77 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  40.96 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  33.7 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  40.43 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  33.7 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  35.11 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  36.44 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  40 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  31.07 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0125  camphor resistance protein CrcB  35.19 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.412784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.86 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  33.72 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  42.86 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40.86 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.23 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.07 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  36.56 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  34.71 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.62 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  37.08 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  40.66 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  41.86 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  36.96 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  34.17 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>