174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1429 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  95.33 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  75 
 
 		 148 aa  239  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  77.18 
 
 		 150 aa  237  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  69.8 
 
 		 171 aa  218  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  57.43 
 
 		 149 aa  186  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  52 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  49.33 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  46.98 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  46.31 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  51.68 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  47.3 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  43.05 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  46 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  45.64 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  45.64 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  45.64 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  45.95 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  43.62 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  43.62 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  43.92 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  49.32 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  44 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  38.93 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  41.61 
 
 		 151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  45.86 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  40.94 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  42.28 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  44.67 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  39.19 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  38.51 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  40.27 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  38.51 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  40.27 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  37.16 
 
 		 164 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  32.67 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  37.41 
 
 		 185 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  41.18 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  34.9 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  37.84 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  35.81 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  40.44 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  35.81 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  34.9 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  35.33 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  35.33 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  35.37 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  35.33 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  35.33 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  34.23 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  35.33 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  35.33 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  35.33 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  35.33 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  39.71 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  37.06 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  36.73 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  39.71 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  36.73 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  40.15 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  35.33 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  36 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  34.67 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  38.24 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  39.71 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  35.76 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  38.97 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  32.65 
 
 		 175 aa  94  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  39.71 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  38.97 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  32 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  40.15 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  31.76 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  35.81 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  34.69 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  35.76 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  34.67 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  35.81 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  32.88 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>