More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2239 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  87.91 
 
 		 306 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  87.91 
 
 		 306 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  62.75 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  64.05 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  61.11 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  61.11 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  60.78 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  63.73 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  60.13 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  60.13 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  61.69 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  61.44 
 
 		 310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  56.17 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  55.23 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  47.25 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  39.41 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  42.16 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  43.46 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  47.4 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  44.12 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  42.26 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  43.49 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  42.62 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  42.54 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  44.16 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  42.26 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  39.42 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  42.86 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  38.26 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  38.26 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  42.12 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  42.04 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  39.48 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  38.1 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  43.2 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  36.01 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  36.42 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  36.45 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  36.04 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  36.66 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  37.34 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  36.71 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  36.72 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  37.25 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  37.25 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  37.14 
 
 		 335 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  34.94 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  35.28 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  35.67 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  36.93 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  36.74 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.15 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.25 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  33.33 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  38.16 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  35.71 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  34.73 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  34.29 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  30.68 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  35.47 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  34.04 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  35.9 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  33.02 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.95 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  35.58 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  32.81 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  37.83 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.96 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.92 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  36.89 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  36.77 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.15 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  29.7 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  29.7 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  29.7 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  35.05 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  35.05 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  35.05 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  35.05 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  35.05 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>