87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1960 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 326 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  83.13 
 
 		 326 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  81.9 
 
 		 326 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  49.5 
 
 		 316 aa  272  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  46.33 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 		 309 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  46.98 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  35.42 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  30.84 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  33.73 
 
 		 642 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.66 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.66 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.3 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  25.96 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.71 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  27.06 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.24 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.24 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 528 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 637 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  20.49 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.49 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 348 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.77 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  23.73 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  19.93 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  19.79 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  19.79 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  19.79 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  19.79 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.85 
 
 		 1132 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  24.62 
 
 		 1041 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8503  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396799  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.13 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  24.19 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  24.51 
 
 		 1065 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 574 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 		 460 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4197  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 623 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 466 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.98 
 
 		 560 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>