More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2230 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 330 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  47.92 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  46.55 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  44.16 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3100  glycosyl transferase family 9  51.65 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.649463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0263  glycosyl transferase family protein  42.54 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.92 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.84 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.04 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.33 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  33.44 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.01 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  32.53 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.2 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  32.2 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.09 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.88 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  32.32 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.26 
 
 		 516 aa  81.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.04 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.74 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.74 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  27.83 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  23.34 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  23.34 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  25.48 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  27.82 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  29.64 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  27.53 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  38.98 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  27.46 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  24.68 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.96 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.03 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.43 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.68 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.43 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  29.75 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  29.51 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  29.8 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  29.51 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  30 
 
 		 779 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  23.44 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.37 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.62 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.03 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.03 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  20.45 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 475 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.14 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  26.33 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.14 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  28.81 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.75 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.03 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.03 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.66 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.23 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  24.67 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.8 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0561  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  43.75 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  28.94 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.49 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  21.58 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.11 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.86 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.46 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.57 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  26.96 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.18 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>