114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1067 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  56.78 
 
 		 235 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  55.51 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  54.04 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  52.12 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  54.66 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  53.81 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  48.5 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  48.07 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  44.21 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  43.78 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  44.21 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  42.98 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  44.3 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  40.69 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  38.86 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  38.16 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  38.33 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  38.6 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  39.65 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  38.72 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  38.5 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  40.09 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  38.77 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  35.96 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  39.04 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  38.74 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  37.72 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  33.48 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  36.28 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  31.64 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  29.61 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  30.68 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  30.68 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  29.71 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  28.43 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  28.02 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  31.49 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  29.15 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  24.43 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  26.11 
 
 		 284 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  29.38 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  26.11 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  26.59 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  26.29 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  29.63 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  29.63 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  29.63 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6188  urease accessory protein UreG  29.57 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  28.25 
 
 		 292 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  28.97 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  30.25 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  29.59 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  27.53 
 
 		 296 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  26.06 
 
 		 268 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  23.24 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  29.65 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  28.99 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  28.65 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  26.26 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  26.14 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  28.99 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  27.81 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  27.93 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  27.93 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  28.99 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  25.44 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  29.08 
 
 		 307 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  29.22 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  27.33 
 
 		 283 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  23.33 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  26.55 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  26.04 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  28.25 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  28.41 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  26.63 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1963  urease accessory protein UreG  28.72 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  26.63 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  25.93 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  26.55 
 
 		 352 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  26.7 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  26.39 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  26.7 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  28.04 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  27.37 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  25 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  22.75 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  30.34 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  28.37 
 
 		 293 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  31.72 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  25.53 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  23.3 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  27.94 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  26.32 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>