32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4763 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  100 
 
 		 384 aa  783    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  37.04 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6290  Type II secretory pathway component PulF-like protein  35.83 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.033403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  27.42 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  24.53 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  23.19 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  20.4 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  22.51 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  23.62 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  20.44 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  23.21 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  23.21 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  23.21 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  23.21 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  23.21 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  23.21 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  20.47 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  23.1 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  22.6 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  22.6 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  20.32 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  23.35 
 
 		 340 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  22.7 
 
 		 359 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  22.7 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  22.61 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>