40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0710 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0710  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16724  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0666  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  97.76 
 
 		 134 aa  249  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  0.345081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0717  putative type-4 frimbrial pilin-related signal peptide protein  45.39 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  36.92 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  30.41 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  37.5 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  28.06 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  25.68 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  31.08 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  32.03 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  29.01 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  32 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  33.33 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  26.36 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  25.6 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  27.54 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  28.24 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  28.24 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  27.46 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  35 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  35 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  24.44 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  26.76 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  27.4 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  37.1 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  26.11 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  25.37 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  27.52 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  24.63 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  30.14 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  33.85 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  24.83 
 
 		 169 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  29.5 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  29.23 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  29.23 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  29.23 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  26.02 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  30.59 
 
 		 131 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  26.47 
 
 		 135 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  29.53 
 
 		 141 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>