More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3613 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  56.79 
 
 		 574 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 577 aa  1171    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  59.5 
 
 		 574 aa  676    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  59.71 
 
 		 571 aa  646    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  59.37 
 
 		 577 aa  687    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  59.71 
 
 		 571 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  61.3 
 
 		 572 aa  680    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  56.68 
 
 		 621 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  52.97 
 
 		 574 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  58.81 
 
 		 585 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  52.16 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  52.52 
 
 		 579 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  51.7 
 
 		 569 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  49.55 
 
 		 580 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 		 586 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  38.51 
 
 		 596 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 		 576 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  37.22 
 
 		 576 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 		 606 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 		 596 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 		 599 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 		 589 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  36.35 
 
 		 605 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 		 570 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 		 610 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  34.13 
 
 		 590 aa  354  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  34.71 
 
 		 591 aa  353  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  32.33 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  32.91 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  34.24 
 
 		 595 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  32.26 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  30.98 
 
 		 555 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  31.36 
 
 		 563 aa  254  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  31.65 
 
 		 556 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 		 556 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  31.47 
 
 		 556 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  29.78 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  32.69 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  32.51 
 
 		 533 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  30.84 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  33.22 
 
 		 565 aa  243  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  30.74 
 
 		 559 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  30.56 
 
 		 594 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 573 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  31.79 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  30.73 
 
 		 580 aa  211  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 		 700 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.25 
 
 		 667 aa  181  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  32.57 
 
 		 634 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.63 
 
 		 614 aa  147  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.35 
 
 		 666 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.3 
 
 		 668 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 		 703 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 		 776 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  31.9 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.46 
 
 		 662 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  29.62 
 
 		 664 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.74 
 
 		 627 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  29.62 
 
 		 664 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 938 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  30 
 
 		 666 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 666 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  29.89 
 
 		 641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 612 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.39 
 
 		 653 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 		 673 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  35.45 
 
 		 705 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.99 
 
 		 746 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 625 aa  127  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.43 
 
 		 579 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 		 1479 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 		 650 aa  127  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 657 aa  127  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 657 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 657 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 657 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 657 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.77 
 
 		 657 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 657 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 657 aa  126  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 657 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.15 
 
 		 584 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.56 
 
 		 598 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.22 
 
 		 757 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.02 
 
 		 850 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 		 328 aa  124  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  28.9 
 
 		 656 aa  123  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  31.99 
 
 		 468 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  32.16 
 
 		 672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.76 
 
 		 715 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 891 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.18 
 
 		 602 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>