89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0742 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  78.02 
 
 		 273 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  76.56 
 
 		 273 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  71.65 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  80.11 
 
 		 176 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  52.09 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  55.51 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  48.4 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  48.16 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  47.13 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  47.58 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  46.77 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  46.15 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  46.96 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  42.97 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  46.28 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  43.8 
 
 		 258 aa  175  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  41.28 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  33.89 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  33.19 
 
 		 390 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  32.78 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  33.19 
 
 		 277 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  33.19 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  33.16 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.92 
 
 		 387 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  39.34 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 296 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 387 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0145  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  29.77 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.15 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  33.51 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  29.93 
 
 		 194 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  39.05 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  29.05 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  26.41 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  32.7 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  28.05 
 
 		 387 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  23.56 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.72 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  30.94 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.57 
 
 		 372 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>