More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3404 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  88.21 
 
 		 212 aa  387  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  65.09 
 
 		 215 aa  278  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  51.16 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  50.93 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  46.46 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  45.18 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  40.95 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  42.71 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  41.49 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  43.82 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  43.07 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  38.89 
 
 		 208 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  44.72 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  40.12 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  40.19 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  42.95 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  42.2 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  42.31 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  31.41 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  35.79 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  39.51 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  42.42 
 
 		 145 aa  115  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  34.1 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  35.08 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  44.78 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  34.87 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  38.73 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.12 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  34.57 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.31 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.67 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  42.54 
 
 		 162 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  34.04 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  36.57 
 
 		 147 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  36.57 
 
 		 147 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  36.57 
 
 		 149 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  40.13 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  38.46 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  28.21 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  38.52 
 
 		 144 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 144 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  39.26 
 
 		 154 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  35.37 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  35.38 
 
 		 138 aa  81.3  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  39.69 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  39.31 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  26.42 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  26.42 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  26.37 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  26.42 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  26.42 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  26.42 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  26.42 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  25.91 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  27.36 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  36.18 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  25.39 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  25.39 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  40.62 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  36.92 
 
 		 769 aa  75.1  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  34.97 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  37.24 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  29.71 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  34.03 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  33.33 
 
 		 158 aa  72  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 		 142 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.48 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  29.09 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.65 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.89 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  34.38 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  33.09 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.11 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  36.03 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.26 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 432 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  35.92 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.07 
 
 		 845 aa  68.6  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  33.11 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  36.09 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  35.29 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  35.21 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>