More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2270 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  89.61 
 
 		 632 aa  1109    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  100 
 
 		 619 aa  1234    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  57.8 
 
 		 604 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3580  ABC transporter related  59.41 
 
 		 607 aa  719    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2457  ABC transporter related  56.65 
 
 		 602 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0218  ABC transporter related  51.24 
 
 		 603 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.045822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.82 
 
 		 611 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 607 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 600 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.59 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.1 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.35 
 
 		 614 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.93 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.89 
 
 		 622 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.49 
 
 		 635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  32.11 
 
 		 600 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.74 
 
 		 617 aa  354  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  34.71 
 
 		 588 aa  353  5.9999999999999994e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.09 
 
 		 597 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.62 
 
 		 597 aa  350  4e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.62 
 
 		 597 aa  350  5e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.12 
 
 		 601 aa  349  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  34.12 
 
 		 584 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  33.8 
 
 		 588 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  36.47 
 
 		 610 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  36.47 
 
 		 610 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.47 
 
 		 610 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.9 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.43 
 
 		 650 aa  345  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 620 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.33 
 
 		 587 aa  343  7e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  30.68 
 
 		 591 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.95 
 
 		 609 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  33.05 
 
 		 590 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.74 
 
 		 625 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  32.84 
 
 		 592 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.53 
 
 		 609 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  34.22 
 
 		 623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.93 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  32.27 
 
 		 589 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.63 
 
 		 600 aa  337  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.56 
 
 		 617 aa  334  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  39.34 
 
 		 1436 aa  334  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.2 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  36.35 
 
 		 600 aa  333  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.12 
 
 		 768 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.9 
 
 		 601 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 592 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.97 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 576 aa  332  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  35.14 
 
 		 594 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  33.79 
 
 		 587 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.48 
 
 		 1257 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 615 aa  330  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  33.84 
 
 		 611 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  33.45 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  34.11 
 
 		 610 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.28 
 
 		 602 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  33.9 
 
 		 611 aa  327  6e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 585 aa  327  6e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  36.86 
 
 		 606 aa  326  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  33.9 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  36.12 
 
 		 610 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 		 587 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.97 
 
 		 602 aa  325  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  33.5 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.56 
 
 		 600 aa  325  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.79 
 
 		 575 aa  325  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  34.75 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 		 587 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  33.12 
 
 		 601 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 		 587 aa  324  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  34.79 
 
 		 782 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  35.7 
 
 		 608 aa  324  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.55 
 
 		 627 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.9 
 
 		 587 aa  323  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  34.44 
 
 		 589 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.7 
 
 		 606 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.18 
 
 		 607 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  31.64 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  31.29 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  32.01 
 
 		 637 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  32.44 
 
 		 608 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  31.6 
 
 		 594 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  33.56 
 
 		 777 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.25 
 
 		 702 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  34.47 
 
 		 782 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.94 
 
 		 592 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.64 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  33.33 
 
 		 598 aa  320  6e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  33.8 
 
 		 626 aa  320  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  33.79 
 
 		 587 aa  320  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.78 
 
 		 582 aa  319  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>