44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1303 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1011    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.480323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1659  hypothetical protein  61.63 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  53.98 
 
 		 1394 aa  97.8  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  59.69 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.46 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.01 
 
 		 2313 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  27.88 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.34 
 
 		 2449 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  47.4 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  41.36 
 
 		 2353 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  46.51 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  52.94 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  44.57 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.28 
 
 		 846 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  50.85 
 
 		 1159 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  50.54 
 
 		 551 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1834  hypothetical protein  34.15 
 
 		 719 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.610374  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.41 
 
 		 261 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  31.94 
 
 		 1000 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  68.67 
 
 		 793 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4107  hypothetical protein  43.59 
 
 		 239 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121168  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  40 
 
 		 633 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  59.52 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  40.16 
 
 		 489 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  59.02 
 
 		 1281 aa  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  41.75 
 
 		 778 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  40.3 
 
 		 916 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  53.25 
 
 		 840 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  52 
 
 		 1217 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  45.87 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02800  hypothetical protein  40 
 
 		 375 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3078  hypothetical protein  38.6 
 
 		 571 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  48.85 
 
 		 675 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  38.4 
 
 		 605 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  38.83 
 
 		 1096 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  50 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  46.9 
 
 		 555 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  54.55 
 
 		 136 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  45 
 
 		 914 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  59.38 
 
 		 1694 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  50.53 
 
 		 735 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  35.97 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  54.55 
 
 		 768 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  34.65 
 
 		 407 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>