155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5075 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5075  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2548  FMN reductase  85.49 
 
 		 193 aa  325  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2040  FMN reductase  81.01 
 
 		 193 aa  304  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2781  NADPH-dependent FMN reductase  76.17 
 
 		 193 aa  291  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03758  FMN reductase  77.78 
 
 		 180 aa  287  8e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0879  NADPH-dependent FMN reductase  64.77 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.227459  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1902  FMN reductase  64.2 
 
 		 192 aa  227  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2164  FMN reductase  61.14 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.878179  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7714  FMN reductase  57.71 
 
 		 191 aa  211  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3915  FMN reductase  58.86 
 
 		 187 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5790  FMN reductase  57.47 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6155  FMN reductase  57.47 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  normal  0.634329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6635  FMN reductase  57.47 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6034  FMN reductase  56.9 
 
 		 186 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0558  FMN reductase  56.25 
 
 		 186 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5804  FMN reductase  56.32 
 
 		 186 aa  200  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2705  FMN reductase  52.57 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34180  NADH-dependent FMN reductase MsuE  53.71 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664146  normal  0.0610177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2905  NADH-dependent FMN reductase MsuE  53.71 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6104  FMN reductase  57.59 
 
 		 189 aa  187  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.141165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4788  NADPH-dependent FMN reductase  48.57 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1694  FMN reductase  53.11 
 
 		 193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1774  FMN reductase  46.59 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2764  NADH-dependent FMN reductase MsuE  50.89 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2990  FMN reductase  50.89 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.907159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5569  FMN reductase  43.12 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0476585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5518  NADPH-dependent FMN reductase  48.81 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1852  NADPH-dependent FMN reductase  42.61 
 
 		 190 aa  154  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5131  NADPH-dependent FMN reductase  49.67 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6093  FMN reductase  42.77 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6506  FMN reductase  42.14 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5008  NADPH-dependent FMN reductase  48.1 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4212  NADPH-dependent FMN reductase  41.32 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1569  NADPH-dependent FMN reductase  39.52 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00531651  hitchhiker  0.0000218303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0771  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1335  NADPH-dependent FMN reductase  44.05 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  45.95 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3404  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3713  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0095822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1143  NADPH-dependent FMN reductase  44.67 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0935648  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5119  NADPH-dependent FMN reductase  43.18 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.948082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3597  NADPH-dependent FMN reductase  44.3 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.686994  normal  0.227288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3727  NADPH-dependent FMN reductase  39.75 
 
 		 224 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3585  NADPH-dependent FMN reductase  45.1 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00310961  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19780  predicted flavoprotein  45.91 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0329903  normal  0.0191485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0760  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30480  predicted flavoprotein  43.66 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.947146  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1725  NADPH-dependent FMN reductase  45.16 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.24959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6110  NADPH-dependent FMN reductase  39.75 
 
 		 176 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0256323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0568  NADPH-dependent FMN reductase  41.29 
 
 		 430 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2598  NADPH-dependent FMN reductase  44.17 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4580  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 		 252 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18720  predicted flavoprotein  37.42 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2005  NADPH-dependent FMN reductase  40.24 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.423484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07440  predicted flavoprotein  37.41 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1937  NADPH-dependent FMN reductase  39.74 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4115  NADPH-dependent FMN reductase  36.13 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2285  NADPH-dependent FMN reductase  39.74 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.595457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2153  NADPH-dependent FMN reductase  38.93 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1931  hypothetical protein  38.15 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4007  NADPH-dependent FMN reductase  40.56 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2450  NADPH-dependent FMN reductase  37.79 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1783  NADPH-dependent FMN reductase  47 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2830  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545681  hitchhiker  0.0067105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3885  NADPH-dependent FMN reductase  37.09 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28930  predicted flavoprotein  37.57 
 
 		 232 aa  97.1  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.287612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1772  NADPH-dependent FMN reductase  40.13 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  55.84 
 
 		 481 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1276  NADPH-dependent FMN reductase  37.28 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1212  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15525  normal  0.0454424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1275  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2421  NADPH-dependent FMN reductase  36.91 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.578118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1830  NADPH-dependent FMN reductase  38.81 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2849  FMN reductase  45.35 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2148  putative NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  40.18 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1337  NADPH-dependent FMN reductase oxidoreductase protein  40 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1214  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4303  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0468815  hitchhiker  0.00179271 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1047  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00941  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.659723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2706  FMN reductase  41.18 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.529701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1046  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1052  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.547438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00948  hypothetical protein  41.18 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2659  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.724178  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2381  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2182  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.758573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1099  NAD(P)H-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  0.428105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1456  NAD(P)H-dependent FMN reductase  33.12 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0388  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0398  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2980  NADPH-dependent FMN reductase  47.19 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0352  NAD(P)H-dependent FMN reductase  35.1 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2223  NADPH-dependent FMN reductase  33.78 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5415  NAD(P)H-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  hitchhiker  0.00193598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4324  NAD(P)H-dependent FMN reductase  42.17 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2620  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000508292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1676  NAD(P)H-dependent FMN reductase  32.47 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1780  NADPH-dependent FMN reductase  46.38 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1645  NAD(P)H-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>