159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4741 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 330 aa  690    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  67.16 
 
 		 340 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  66.67 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  64.13 
 
 		 333 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  64.2 
 
 		 328 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  59.44 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  48.34 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  40.32 
 
 		 564 aa  195  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02380  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 		 236 aa  170  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.042266 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 		 338 aa  142  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  33.54 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  34.28 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  34.22 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  35.29 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  33.11 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  32.5 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  36.3 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  35.35 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  31.11 
 
 		 318 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  34.97 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  32.01 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  30.75 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  28.86 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  36.78 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  31.07 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  29.52 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  30.7 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  31.69 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  30.6 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 319 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  29.39 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  30.7 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  30.7 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  30.7 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  28.04 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  29.81 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  29.94 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  30.03 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  28.89 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  29.09 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  29.87 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  30.28 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  29.66 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  30.37 
 
 		 343 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  28.7 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.74 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  29.55 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  29.77 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  27.97 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  27.97 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.27 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.63 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  31.51 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  31.51 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  31.51 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  28.81 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.68 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.61 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  29.43 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  29.08 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  29.08 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  30.03 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.69 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  30.06 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  28.62 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.05 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  27.38 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  28.25 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.07 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  27.67 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.46 
 
 		 353 aa  92.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  29.15 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  26.77 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  30.54 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  28.31 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  30.27 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  27.24 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  28.94 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.91 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00077  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12242)  29.14 
 
 		 338 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.61 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.61 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  29.54 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  29.93 
 
 		 334 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  31.64 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02655  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00800)  27.49 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263931 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>