116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1225 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  82.29 
 
 		 271 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 		 280 aa  330  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  61.05 
 
 		 272 aa  329  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  61.13 
 
 		 271 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  58.11 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  59.16 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  55.64 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  55.08 
 
 		 284 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  53.38 
 
 		 287 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  56.63 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  53.99 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  45.95 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  45.1 
 
 		 273 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  44.44 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  46.28 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  44.08 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  43.37 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  45.13 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  41.41 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  35.18 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  36.63 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  42.6 
 
 		 176 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  35.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  34.29 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  33.88 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  33.75 
 
 		 390 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  32.22 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  28.99 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.02 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  24.48 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  21.43 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  21.43 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  21.43 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  24.3 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.62 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  26.56 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.95 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  19.84 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 322 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  22.39 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.02 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  23.24 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 279 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 		 290 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  24.38 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  22.13 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  21.6 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.51 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2815  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.92 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0170711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 1005 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 1005 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 1005 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  21.64 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  19.38 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>