47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0977 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  357  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  79.41 
 
 		 174 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  56.41 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  60.14 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  55.13 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  50.97 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  52.47 
 
 		 165 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  53.74 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  53.9 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  52.38 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  52.35 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  52.35 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  52.38 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  52.38 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  51.02 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  46.92 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  41.98 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  44.35 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  44.53 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  50.52 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  43.08 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  42.31 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  56.94 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  39.13 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  45.11 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  52.5 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  52.5 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  52.5 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  52.5 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  57.14 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  43.18 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  40.16 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  39.52 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  43.94 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  35.2 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  32.19 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  28.77 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  32.14 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  32.79 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  34.15 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  31.71 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  27.59 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  28.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  28.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>