88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0164 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  126  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  81.54 
 
 		 65 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  60 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  60 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  60 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  55.07 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  55.07 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0111  sulfur carrier protein ThiS  53.42 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0761015  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  46.97 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.38 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  42.19 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.3 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 64 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 67 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0798  putative ThiS sulfur transfer protein  44.44 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.85 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2432  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.660547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 73 aa  40  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 73 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>