More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2153 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  63.58 
 
 
193 aa  225  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 
171 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.76 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  62.07 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  60.38 
 
 
178 aa  193  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.54 
 
 
180 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  57.82 
 
 
182 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  58.74 
 
 
184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  55.78 
 
 
168 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  59.59 
 
 
183 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.37 
 
 
230 aa  188  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  55.77 
 
 
179 aa  187  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  56.55 
 
 
213 aa  187  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
184 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 
159 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.14 
 
 
184 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 
159 aa  185  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 
159 aa  185  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 
159 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 
159 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.71 
 
 
170 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
182 aa  184  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.55 
 
 
794 aa  184  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  57.34 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.1 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  56.16 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  56.94 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 
226 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  55.35 
 
 
264 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.17 
 
 
791 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.86 
 
 
794 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.86 
 
 
202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  57.45 
 
 
264 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  59.03 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  54.42 
 
 
213 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.18 
 
 
225 aa  180  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
174 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  55.94 
 
 
184 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  55.24 
 
 
185 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  55.24 
 
 
184 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 
181 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.53 
 
 
184 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  55.94 
 
 
184 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  57.75 
 
 
167 aa  180  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  55.24 
 
 
184 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.79 
 
 
792 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2549  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
224 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 
224 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1494  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 
159 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
250 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.17 
 
 
183 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  59.31 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  53.79 
 
 
183 aa  178  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 
167 aa  178  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.77 
 
 
170 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
226 aa  177  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 
173 aa  177  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.38 
 
 
183 aa  177  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.69 
 
 
794 aa  177  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.61 
 
 
793 aa  177  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.23 
 
 
163 aa  177  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.23 
 
 
163 aa  177  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.23 
 
 
163 aa  177  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  54.09 
 
 
170 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3366  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.93 
 
 
224 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1395  NADH dehydrogenase subunit B  59.03 
 
 
224 aa  176  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2771  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 
224 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1493  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 
224 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28450  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 
224 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  52.41 
 
 
182 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.45 
 
 
200 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
165 aa  176  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  57.93 
 
 
224 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  54.86 
 
 
226 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  48.84 
 
 
212 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 
183 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.45 
 
 
200 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3604  NADH dehydrogenase subunit B  57.93 
 
 
224 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  53.42 
 
 
180 aa  175  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>