179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0395 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  100 
 
 
638 aa  1302    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  48.25 
 
 
900 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  49.92 
 
 
666 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  47.16 
 
 
689 aa  588  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  47.16 
 
 
756 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  47.52 
 
 
668 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  45.53 
 
 
655 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  44.73 
 
 
655 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  45.21 
 
 
655 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  45.05 
 
 
655 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  44.23 
 
 
732 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  42.28 
 
 
792 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  43.57 
 
 
792 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  44.76 
 
 
793 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  40.71 
 
 
815 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  43.72 
 
 
801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  41.05 
 
 
811 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  41.68 
 
 
818 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  41.08 
 
 
745 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  42.54 
 
 
821 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  40.78 
 
 
816 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  39.67 
 
 
770 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  40.43 
 
 
775 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  39.83 
 
 
778 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  38.13 
 
 
838 aa  362  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  36.84 
 
 
663 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  29.48 
 
 
610 aa  283  9e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  28.91 
 
 
603 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.48 
 
 
619 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  27.76 
 
 
631 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  33.23 
 
 
1026 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  29.64 
 
 
1079 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  28.41 
 
 
628 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.44 
 
 
640 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  27.62 
 
 
623 aa  219  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  30.96 
 
 
526 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.23 
 
 
620 aa  203  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.76 
 
 
649 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.73 
 
 
480 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.75 
 
 
482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.74 
 
 
446 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.63 
 
 
506 aa  84  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.2 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  22.47 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.38 
 
 
834 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  23.77 
 
 
922 aa  67  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.68 
 
 
824 aa  66.2  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.93 
 
 
504 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.29 
 
 
821 aa  65.1  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.16 
 
 
686 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.85 
 
 
516 aa  64.7  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.76 
 
 
823 aa  64.3  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.06 
 
 
768 aa  64.7  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.26 
 
 
559 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.23 
 
 
822 aa  63.9  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.45 
 
 
551 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  27.22 
 
 
883 aa  61.6  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  23.83 
 
 
688 aa  60.8  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.19 
 
 
517 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.98 
 
 
845 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.12 
 
 
846 aa  60.1  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.01 
 
 
835 aa  59.3  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  23.43 
 
 
829 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.51 
 
 
822 aa  57.4  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  25.24 
 
 
877 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  25.24 
 
 
877 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  25.82 
 
 
647 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.26 
 
 
857 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  24.76 
 
 
877 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2457  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.57 
 
 
642 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.982771  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.8 
 
 
606 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  25.5 
 
 
877 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.24 
 
 
504 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.26 
 
 
857 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  20.41 
 
 
827 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.24 
 
 
905 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.4 
 
 
642 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.62 
 
 
860 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  25.77 
 
 
877 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1078  M1 family peptidase  29.11 
 
 
598 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000177882  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  25.77 
 
 
877 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.41 
 
 
863 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1551  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.75 
 
 
615 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.043081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  25.77 
 
 
877 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  25.77 
 
 
918 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13602  predicted protein  26.02 
 
 
620 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0213622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.1 
 
 
593 aa  54.3  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2628  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.51 
 
 
647 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000178054  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2339  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.09 
 
 
642 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1757  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.51 
 
 
647 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000341023  normal  0.0233957 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  25.35 
 
 
671 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2267  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.09 
 
 
642 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283529  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  31.13 
 
 
670 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2703  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.51 
 
 
647 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000156716  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0899  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.51 
 
 
573 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.276688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  24.74 
 
 
877 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.97 
 
 
673 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2589  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.51 
 
 
647 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000915199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2314  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.09 
 
 
652 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00696087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  28.29 
 
 
643 aa  52.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>