More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2776 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2776  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2520  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  93.83 
 
 
162 aa  314  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747102  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2791  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  77.78 
 
 
162 aa  265  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4003  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.25 
 
 
177 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0200  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.53 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.234084  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0230  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.8 
 
 
166 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2054  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.75 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0154  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.07 
 
 
168 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0281  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.96 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.57 
 
 
169 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0612  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.74 
 
 
155 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4583  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.02 
 
 
164 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.870421 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.02 
 
 
161 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1071  hypothetical protein  37.42 
 
 
168 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4808  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.82 
 
 
159 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0909  hypothetical protein  36.81 
 
 
168 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0967  hypothetical protein  36.81 
 
 
168 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0872  transcriptional regulator  36.81 
 
 
168 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0670352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5746  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.67 
 
 
160 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9039  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 
157 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3061  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.12 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.325314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2899  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.84 
 
 
162 aa  97.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0224  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.36 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.997359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2958  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.16 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01670  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  36.99 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10320  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.53 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2876  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.31 
 
 
159 aa  94  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20720  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  36.69 
 
 
169 aa  94  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0320  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.72 
 
 
180 aa  94  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.0912799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3516  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.68 
 
 
180 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00768714  normal  0.63331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2361  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.61 
 
 
179 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55927  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2937  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.49 
 
 
173 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675377  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3156  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.08 
 
 
180 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.22058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2120  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.65 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1261  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.88 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3967  transcriptional regulator  31.61 
 
 
174 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2271  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.41 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448582  normal  0.516915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29300  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0683  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.26 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000630574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2779  rrf2 family protein  33.33 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.11 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2975  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.9 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.672436  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2514  rrf2 family protein  33.33 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0618059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2582  rrf2 family protein  33.85 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0122402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2769  rrf2 family protein  33.85 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4312  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.27 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.784229  normal  0.0976927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1366  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1265  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.63 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.83 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.371305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2583  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.63 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2571  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.6 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2964  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.12 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00065561  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0074  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216243  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0485  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.04 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0373904  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0579  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.12 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000125855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2269  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.7 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.85 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0339289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1607  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.14 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.690617  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1375  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.59 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1940  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.33 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0818  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.53 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5300  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.94 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0779  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.56 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.133557  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2672  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  27.94 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.6 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01980  Rrf2 family protein  38.89 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2094  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0819  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0830  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.33 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.6836  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  27.54 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.54 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.54 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0208  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.5 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113346  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0730  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.81 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1906  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.5 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000482606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1639  Rrf2 family protein  30.5 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0538  hypothetical protein  33.94 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.209147  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1300  hypothetical protein  35.24 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  27.54 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2078  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.46 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011336  hitchhiker  0.00000000000000153974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1295  rrf2 family protein  30.71 
 
 
137 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1266  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.82 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1024  RrF2 family protein  26.67 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1552  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  29.08 
 
 
144 aa  62  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0323916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  31.62 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000242173  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1119  RrF2 family protein  28.33 
 
 
131 aa  61.6  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0514127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1931  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.55 
 
 
135 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501375  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.65 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1168  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.43 
 
 
134 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000039809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  26.14 
 
 
175 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1748  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  30.47 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  30.09 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2259  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.11 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1594  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  31.71 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.202596  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1406  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  25.36 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0735684  normal  0.656716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1002  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.283031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1268  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  32.84 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000462831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2519  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.71 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  0.623317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0423  transcriptional regulator  28.99 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0961866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1973  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  29.58 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>