More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2277 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  100 
 
 		 591 aa  1185    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.66 
 
 		 609 aa  702    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.03 
 
 		 619 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  90.69 
 
 		 589 aa  1068    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  62.88 
 
 		 598 aa  712    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  59.11 
 
 		 604 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  60.06 
 
 		 691 aa  738    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  59.36 
 
 		 623 aa  690    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  63.18 
 
 		 589 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  78.85 
 
 		 592 aa  955    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  59.65 
 
 		 622 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  63 
 
 		 596 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.26 
 
 		 619 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  59.49 
 
 		 625 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.26 
 
 		 619 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.19 
 
 		 622 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.45 
 
 		 626 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.53 
 
 		 596 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.21 
 
 		 589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  54.04 
 
 		 581 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.24 
 
 		 576 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  58.47 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.68 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.92 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  53.38 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  52.04 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.56 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  53.5 
 
 		 381 aa  348  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  32.37 
 
 		 695 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.77 
 
 		 570 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  37.96 
 
 		 369 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  31.51 
 
 		 659 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  63.51 
 
 		 189 aa  208  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  62.24 
 
 		 188 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  56.88 
 
 		 187 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  63.19 
 
 		 193 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  63.19 
 
 		 193 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  63.19 
 
 		 193 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  62.5 
 
 		 193 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  61.38 
 
 		 197 aa  194  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  61.38 
 
 		 197 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  56.29 
 
 		 186 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  56.55 
 
 		 178 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  57.24 
 
 		 178 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.97 
 
 		 200 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  54.48 
 
 		 184 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  64.66 
 
 		 193 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  55.17 
 
 		 178 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  45.86 
 
 		 581 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  41.94 
 
 		 249 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  40.85 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.24 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  39.29 
 
 		 644 aa  112  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.13 
 
 		 612 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  35.58 
 
 		 697 aa  110  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  38.03 
 
 		 504 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  38.56 
 
 		 674 aa  110  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.84 
 
 		 699 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.1 
 
 		 628 aa  109  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  37.86 
 
 		 672 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 		 639 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.88 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.46 
 
 		 634 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.17 
 
 		 612 aa  104  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  33.12 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  36.99 
 
 		 487 aa  98.2  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 		 688 aa  97.8  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  21.17 
 
 		 403 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 		 641 aa  94  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  20.92 
 
 		 403 aa  93.6  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  35.16 
 
 		 584 aa  87.4  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  24.35 
 
 		 735 aa  86.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.04 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  30.34 
 
 		 167 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.2 
 
 		 173 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.64 
 
 		 228 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.86 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.15 
 
 		 196 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.58 
 
 		 238 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  32.12 
 
 		 182 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  31.21 
 
 		 165 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3286  cytochrome c biogenesis protein  33.66 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.75 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  27.78 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  20 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  29.93 
 
 		 155 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  28.47 
 
 		 155 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  30.87 
 
 		 169 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  28.47 
 
 		 155 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.34 
 
 		 189 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.14 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.99 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  24.47 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  30.71 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.85 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  31.82 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  31.69 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>