153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5903 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  65.85 
 
 
451 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  66.07 
 
 
451 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  86.16 
 
 
453 aa  827    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  85.56 
 
 
457 aa  831    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  97.81 
 
 
456 aa  937    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  66.07 
 
 
451 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  66.07 
 
 
451 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  66.07 
 
 
451 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  65.85 
 
 
451 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  66.07 
 
 
451 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  65.85 
 
 
451 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
456 aa  953    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  63.78 
 
 
451 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  64 
 
 
451 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  63.78 
 
 
451 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  63.78 
 
 
451 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  63.78 
 
 
451 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  63.76 
 
 
446 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  60.32 
 
 
437 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  56.07 
 
 
468 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  55.86 
 
 
468 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  57.78 
 
 
439 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  57.01 
 
 
441 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  56.7 
 
 
449 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  52.82 
 
 
438 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  53.05 
 
 
438 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  51.69 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  51.8 
 
 
432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  48.98 
 
 
432 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  48.54 
 
 
435 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  47.65 
 
 
440 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  47.54 
 
 
441 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  44.7 
 
 
430 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  44.49 
 
 
430 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  46.65 
 
 
438 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  43.2 
 
 
441 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  44.09 
 
 
462 aa  363  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  43.27 
 
 
439 aa  363  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  41.87 
 
 
435 aa  343  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  40.49 
 
 
439 aa  328  9e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  41.4 
 
 
435 aa  322  8e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  38.51 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  41.87 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  34.22 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  32.68 
 
 
447 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 
490 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  30.75 
 
 
488 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  30.77 
 
 
488 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  29.04 
 
 
490 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  30.18 
 
 
426 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  28.85 
 
 
475 aa  183  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 
426 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  26.74 
 
 
476 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 
487 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  28.29 
 
 
463 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  25.72 
 
 
452 aa  166  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  25.9 
 
 
474 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  23.7 
 
 
460 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  27.16 
 
 
447 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  26.46 
 
 
436 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
466 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  27.91 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  28.12 
 
 
441 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  27.91 
 
 
441 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  27.91 
 
 
441 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  27.91 
 
 
441 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  27.91 
 
 
441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  27.91 
 
 
441 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  27.7 
 
 
441 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  27.7 
 
 
441 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  25.92 
 
 
452 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  27.7 
 
 
441 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  25.82 
 
 
448 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 
441 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  25.96 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 
424 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  24.13 
 
 
441 aa  123  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  25.22 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  23.74 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  24.58 
 
 
440 aa  120  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  23.93 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 
435 aa  113  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  25 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  24.06 
 
 
463 aa  110  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  23.59 
 
 
437 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 
437 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  22.86 
 
 
440 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  22.92 
 
 
468 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  25.38 
 
 
452 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1749  glycoside hydrolase family 4  24.9 
 
 
466 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  25.56 
 
 
410 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0177  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 
471 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
427 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  22.66 
 
 
450 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  27.32 
 
 
460 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 
433 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  22.66 
 
 
450 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>