More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5485 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
358 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  95.25 
 
 
358 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.32 
 
 
336 aa  116  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 
347 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
337 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  38.93 
 
 
353 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 
355 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 
347 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  25.53 
 
 
341 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  25.53 
 
 
341 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  40.28 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
337 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.82 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.52 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.6 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 
377 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  40.46 
 
 
359 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
403 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.79 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  26.2 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 
359 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.68 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.02 
 
 
342 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  25.36 
 
 
330 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 
351 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
327 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  34.39 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  35.76 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  33.07 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.24 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.84 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  33.07 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.6 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  25.19 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  35.07 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.24 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  34.59 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
326 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  34.59 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  34.59 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  34.59 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  34.59 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.22 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  39.13 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.05 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
448 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  27.16 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.4 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  39.72 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  24.25 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.72 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  25.13 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  24.52 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  26.43 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  25 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.91 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  30.29 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  24.2 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  24.4 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.69 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>