More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4018 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  94.68 
 
 
357 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
365 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  82.63 
 
 
357 aa  614  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  59.31 
 
 
356 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  46.29 
 
 
364 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  46.29 
 
 
365 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  45.98 
 
 
361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  37.87 
 
 
355 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 
385 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 
366 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 
371 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  33.43 
 
 
404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 
373 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 
361 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 
387 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 
388 aa  159  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  31.96 
 
 
400 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
366 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  31.81 
 
 
391 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 
347 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 
383 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  34.48 
 
 
331 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
350 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.74 
 
 
369 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.4 
 
 
356 aa  129  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  34.89 
 
 
360 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  34.89 
 
 
360 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 
374 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
350 aa  125  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  32.9 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  29.14 
 
 
343 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  37.29 
 
 
349 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
345 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  33.98 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  31.09 
 
 
353 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
377 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  29.72 
 
 
363 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
358 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
412 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
342 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.19 
 
 
337 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 
335 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  32.63 
 
 
345 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
366 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 
364 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
356 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 
359 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
333 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  30.85 
 
 
387 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
357 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 
387 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 
388 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.15 
 
 
353 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 
333 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
359 aa  95.9  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
359 aa  95.9  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.54 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
359 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.85 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
376 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 
339 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  28.95 
 
 
366 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  26.65 
 
 
335 aa  90.1  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 
356 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 
352 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
350 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
341 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 
358 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
340 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  29.24 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  31.41 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>