191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3713 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3713  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
213 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  96.24 
 
 
213 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1322  lysine exporter protein LysE/YggA  51.44 
 
 
212 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  26.57 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  26.49 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.71 
 
 
209 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  27.27 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  27.27 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  27.27 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  25.26 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  36.54 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.5 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  25.26 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  25.26 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  27.47 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  36.54 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  36.54 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  36.54 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  26.5 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  25.26 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.54 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  30.77 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  30.77 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  28.57 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.54 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  35.59 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  25.76 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  23.59 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.59 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  29.2 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.64 
 
 
203 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  28.02 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  27.59 
 
 
223 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  25.77 
 
 
212 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  29.53 
 
 
209 aa  52  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  25.13 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.9 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  25.24 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  25.24 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  25.24 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  29.91 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.39 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  30.77 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  25.24 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  25.24 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  25.24 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  25.24 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.13 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  25.51 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  26.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  27.04 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  25.13 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3860  lysine exporter protein LysE/YggA  24.14 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  26.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  24.87 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  26.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  24.76 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  26.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  25 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  26.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  29.91 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  24.35 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  24.35 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  28.1 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  30.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  24.35 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.99 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  24.35 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  25.7 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  25.7 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  24.35 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  25.13 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.35 
 
 
212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  32.41 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  24.35 
 
 
212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  24.35 
 
 
212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.55 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  29.66 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0237  hypothetical protein  25.97 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  28.83 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 
212 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0850  lysine exporter protein LysE/YggA  23.35 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0203758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  22.95 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  24.04 
 
 
204 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  30.08 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>