More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1533 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  100 
 
 
259 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3123  hypothetical protein  70.43 
 
 
189 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
264 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
284 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  31.85 
 
 
275 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  26.69 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  31.42 
 
 
275 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  29.3 
 
 
274 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  26.86 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  28.09 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 
495 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.09 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  32.59 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  22.09 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  21.65 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  23.3 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  20.87 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  20.87 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  22.05 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  21.26 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5296  Methyltransferase type 11  23.33 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  26.58 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  24.67 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  24.03 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  27.51 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  25.1 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  24.5 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  30.3 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  33.75 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  25.29 
 
 
242 aa  62.4  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  22.44 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  29.68 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  27.37 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  27.69 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  22.56 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3499  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  23.62 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
252 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6333  Methyltransferase type 11  25.21 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00315247  hitchhiker  0.000727551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  29.1 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.34 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  28.36 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  27.42 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  31.96 
 
 
198 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  28.09 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  29.92 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  26.87 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  29.53 
 
 
310 aa  55.8  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.64 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  28.74 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  30.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  28 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  24.87 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0450  methyltransferase type 12  27.21 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  21.51 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  28.74 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  28.74 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  24.03 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  27.21 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0349  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  24.41 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>