More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1438 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1438  cysteine synthase A  100 
 
 		 345 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536284  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1617  cysteine synthase A  94.77 
 
 		 345 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1363  cysteine synthase A  81.74 
 
 		 346 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1879  cysteine synthase  83.14 
 
 		 345 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  80.18 
 
 		 342 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1053  cysteine synthase A  78.7 
 
 		 342 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1018  cysteine synthase A  78.4 
 
 		 342 aa  558  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  76.25 
 
 		 346 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  75.65 
 
 		 345 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  72.17 
 
 		 366 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  73.47 
 
 		 345 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3861  cysteine synthase A  73.31 
 
 		 343 aa  527  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  73.68 
 
 		 346 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2147  cysteine synthase A  73.51 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0821  cysteine synthase A  73.51 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0212219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0819  cysteine synthase A  72.92 
 
 		 344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.39 
 
 		 343 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2922  cysteine synthase A  75.3 
 
 		 336 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  72.32 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4677  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  73.49 
 
 		 342 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2314  putative cysteine synthase A  71.51 
 
 		 345 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.6 
 
 		 352 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2323  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.91 
 
 		 343 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1993  cysteine synthase A  70.18 
 
 		 341 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1493  cysteine synthase A  71.08 
 
 		 333 aa  491  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  72.59 
 
 		 332 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.01 
 
 		 343 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1666  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  67.98 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1391  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  68.58 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1100  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  67.36 
 
 		 349 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1387  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  67.87 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1525  cysteine synthase A  64.62 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0343  cysteine synthase A  66.15 
 
 		 340 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.273695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2067  cysteine synthase A  64.33 
 
 		 346 aa  434  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3927  cysteine synthase A  59.77 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  62.12 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1121  cysteine synthase A  60 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1275  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  61.59 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  63.09 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  61.35 
 
 		 324 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  60.43 
 
 		 324 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.97 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  58.97 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  58.48 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  58.9 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  59.2 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  58.9 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  59.2 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  61.47 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1489  cysteine synthase A  62.46 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  57.06 
 
 		 325 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1616  cysteine synthase A  60.96 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.67 
 
 		 325 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  57.55 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1893  cysteine synthase A  59.2 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.484332  normal  0.0992226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  56.88 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05880  cysteine synthase, putative  54.46 
 
 		 405 aa  332  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.254646  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  54.1 
 
 		 370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59891  cysteine synthase (CYSK1)  49.85 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0676  cysteine synthase A  42.55 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3653  cysteine synthase A  41.74 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.34 
 
 		 453 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  39.09 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.39 
 
 		 459 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.09 
 
 		 459 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  39.94 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  39.32 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.67 
 
 		 459 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41218  predicted protein  38.81 
 
 		 414 aa  232  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  40.06 
 
 		 458 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.91 
 
 		 496 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  40.98 
 
 		 463 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  39.81 
 
 		 457 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01513  hypothetical transmembrane protein (Eurofung)  41.74 
 
 		 428 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  39.88 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  39.2 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  39.94 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  39.69 
 
 		 479 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  41.16 
 
 		 456 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.62 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  42.39 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  41.59 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  40.55 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  40.85 
 
 		 456 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30734  cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  42.59 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.207324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  40.66 
 
 		 521 aa  212  7e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54915  eukaryotic cysteine synthase  39.71 
 
 		 356 aa  212  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02520  cysteine synthase, putative  37.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  39.88 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  40 
 
 		 461 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  40.37 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  40.61 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  40.9 
 
 		 462 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.68 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  39.63 
 
 		 464 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.18 
 
 		 455 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  36.9 
 
 		 464 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.65 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  38.55 
 
 		 463 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>