More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6036 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
255 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
274 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
246 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
246 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
246 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.87 
 
 
245 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.82409  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.06 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.6 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
255 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
258 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
254 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.32 
 
 
251 aa  171  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
253 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
251 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
254 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
254 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
257 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.64 
 
 
246 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
257 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
257 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
258 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
262 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
255 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
259 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
256 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 
255 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
241 aa  168  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
248 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.2 
 
 
253 aa  168  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
264 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
246 aa  168  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.87 
 
 
254 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.3 
 
 
258 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
245 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.82 
 
 
246 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
262 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2598  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.88 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.02 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  37.65 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
255 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
256 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
239 aa  166  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
251 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
253 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
247 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.83 
 
 
247 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
252 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  38.67 
 
 
260 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
269 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.16 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  37.85 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.62 
 
 
245 aa  165  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  40.16 
 
 
250 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
254 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.85 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
261 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 
256 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
258 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.13 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  40.24 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
255 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
246 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
266 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
255 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
254 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
252 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 
249 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
256 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
260 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
254 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>