More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3546 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  81.37 
 
 		 438 aa  711    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3546  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 436 aa  888    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.984037  normal  0.12163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  51.1 
 
 		 876 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  31.72 
 
 		 896 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  32.77 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  30.68 
 
 		 937 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.95 
 
 		 945 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  30.34 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  31.8 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.79 
 
 		 767 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  30.9 
 
 		 478 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  31.87 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0178  peptidase M16 domain protein  28.05 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4236  processing peptidase  28.04 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4197  peptidase M16 domain protein  28.04 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  28.54 
 
 		 490 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  28.06 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1347  peptidase M16 domain protein  34.38 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  30.73 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  29.88 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  28.29 
 
 		 969 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0365  processing peptidase  28.89 
 
 		 424 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  31.37 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  27.82 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  27.93 
 
 		 490 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  29.12 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  26.15 
 
 		 929 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  27.7 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  32.77 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  31.05 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4310  peptidase M16-like  28.39 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  28.95 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.37 
 
 		 496 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  28.88 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  29.89 
 
 		 497 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0966  peptidase M16-like  29.18 
 
 		 413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  32.18 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  31.98 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  31.49 
 
 		 462 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  29.93 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  31.93 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  31.93 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  30.81 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  30.18 
 
 		 495 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  31.22 
 
 		 464 aa  149  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  29.43 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  31.92 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  28.1 
 
 		 687 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  31.22 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  30.88 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  29.1 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  35.2 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.05 
 
 		 943 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  27.12 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  29.06 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  30.51 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4631  peptidase M16 domain-containing protein  29.32 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  28.88 
 
 		 506 aa  147  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  30.65 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  25.96 
 
 		 725 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  31.54 
 
 		 437 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  30.38 
 
 		 519 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  27.67 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  26.52 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  27.49 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  29.76 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  32.41 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  30.38 
 
 		 520 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  29.38 
 
 		 495 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  30.14 
 
 		 520 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  28.19 
 
 		 495 aa  143  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  28.93 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1226  processing protease  31.16 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  27.62 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  25.76 
 
 		 959 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  24.44 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  29.6 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  28.5 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  28.71 
 
 		 921 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  26.28 
 
 		 481 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  26.63 
 
 		 419 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.34 
 
 		 494 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.27 
 
 		 954 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  25.83 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  29.44 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  25.75 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  28.74 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  28.57 
 
 		 495 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  27.53 
 
 		 974 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  25.54 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  28.16 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  28.3 
 
 		 959 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.06 
 
 		 947 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  25.54 
 
 		 482 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  26.62 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>