More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1548 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1548  transposase  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  65.56 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  65.56 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  65.56 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  64.13 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  59.78 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  59.78 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  60.87 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  60.87 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  62.37 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  62.37 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  62.37 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  63.95 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  57.78 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  56.67 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  56.67 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  59.26 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  59.26 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  58.89 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  58.89 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  58.89 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  58.89 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  57.14 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  56.67 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  56.67 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  56.67 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  56.67 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  56.67 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  56.67 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  53.93 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  55.32 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  55.56 
 
 		 97 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  55.56 
 
 		 97 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  58.44 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 		 383 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  51.11 
 
 		 90 aa  84.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  61.04 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  58.9 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  58.9 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  49.4 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  55.13 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  44.71 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  43.37 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  63.64 
 
 		 57 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  63.64 
 
 		 57 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  56.67 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  46.59 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  46.59 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  46.59 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  46.59 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  46.59 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  46.59 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  46.59 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  38.54 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  42.05 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  42.05 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  42.05 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  45.16 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  45.16 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  39.8 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  39.58 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  36.59 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  36.59 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  36.59 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  42.05 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.750482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>