More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0213 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  45.04 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  44.54 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  47.83 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  42.92 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  42.42 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  39.91 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  41.3 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  45.96 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  42.17 
 
 		 247 aa  177  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  40.43 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  41.03 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  39.74 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  40.6 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  39.83 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  39.32 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  39.39 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  33.48 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  35.93 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  37.39 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  32.17 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  31.38 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  30.88 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  36.16 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  34.5 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.99 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  32.99 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  31.67 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  30.81 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 		 247 aa  85.1  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  34.71 
 
 		 282 aa  85.1  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 		 225 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.49 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  32.07 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  30.53 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  27.78 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  32.32 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  28.29 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  32.93 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  30.98 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  35.58 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  28.79 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  33.54 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  31.36 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  34.84 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  31.01 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  26.83 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  28.96 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  30.51 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  32.27 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  34.03 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  33.67 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  33.53 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  29.81 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  28.08 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.48 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  27.49 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  32.08 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  29.19 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  34.69 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  35.58 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  32.94 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  31.98 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.16 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  30.65 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  29.01 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  27.01 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  31.85 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  32.59 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  27.01 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  28.8 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  27.51 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  27.01 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  30.34 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.58 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  32.49 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  31.22 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  28.28 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  28.84 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  30.43 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  33.81 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  28.91 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  25.5 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  28.17 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>