120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0152 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  100 
 
 		 379 aa  764    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  100 
 
 		 372 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  93.28 
 
 		 372 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  63.61 
 
 		 372 aa  464  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  60.38 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  42.02 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  38.67 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  38.56 
 
 		 369 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  37.87 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  39.76 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.06 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  33.84 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.01 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  39.82 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  35.42 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  34.58 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.74 
 
 		 347 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  37.5 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.73 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  33.07 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  32.16 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.6 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  33.84 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  33.86 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  34.34 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  30.84 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.58 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  30.52 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  35.07 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  34.01 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  32.28 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  28.63 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  27.23 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  27.23 
 
 		 328 aa  93.6  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.2 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  30.36 
 
 		 302 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  28.68 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  28.68 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  30.83 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  28.86 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  26.37 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  28.86 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.92 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  26.58 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.23 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  27.76 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.13 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.31 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  26.89 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  24.6 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.86 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  25.71 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  29.82 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.29 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  28.76 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  28.46 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  28.76 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  28.14 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  27.87 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  28.03 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  25.41 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  26.01 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  22.63 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  27.46 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  30.88 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  26.24 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.78 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  30.88 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  32.88 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  30.88 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.16 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  29.05 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.81 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.89 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.62 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.61 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  28.26 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  31.21 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  30.09 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  27.41 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.15 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.11 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  29.58 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  29.58 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  29.58 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  28.38 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  26.79 
 
 		 781 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  30.15 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  30.15 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  30.15 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  30.15 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  24.1 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  25.88 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  25.88 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>