35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0136 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  36.1 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  32.95 
 
 		 383 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  36.11 
 
 		 360 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  31.75 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  35.83 
 
 		 373 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  35.43 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  31.2 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  29.78 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  30.53 
 
 		 344 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  28.8 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  26.57 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  28.51 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  25.63 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  32.26 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  26.77 
 
 		 384 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 357 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 404 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29.32 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  25.76 
 
 		 356 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  25 
 
 		 419 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  25.95 
 
 		 344 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  28.99 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  29.03 
 
 		 197 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.75 
 
 		 407 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  26 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  29.66 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  28 
 
 		 437 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  22.1 
 
 		 349 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  22.96 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  26.32 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  23.58 
 
 		 444 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  26.42 
 
 		 400 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  26.42 
 
 		 400 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>