More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2353 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  78.03 
 
 		 132 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  76.52 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  75 
 
 		 132 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  72.73 
 
 		 133 aa  191  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  56.2 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  54.55 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  38.97 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  43.1 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  38.98 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  42.24 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  35.48 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  36.84 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  36.75 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  36.75 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  36.75 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  36.75 
 
 		 199 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  42.99 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  32.43 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  32.43 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  32.43 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  42.53 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  34.45 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  31.88 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  39.77 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  39.77 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  39.77 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  39.77 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  39.77 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  39.77 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  38.64 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  38.64 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  38.64 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  39.77 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  38.75 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  29.73 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  30.56 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  34.78 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  33.05 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  31.13 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  29.31 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  31.13 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  39.24 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  39.24 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  39.24 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  31.48 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  39.24 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  39.24 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  30.63 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  30.84 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  31.3 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  29.91 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  29.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  29.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  29.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  29.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  33.33 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  29.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>