55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1129 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  48.85 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 		 170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  40.48 
 
 		 390 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 170 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 166 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  37.6 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 464 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 201 aa  88.2  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 176 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 176 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  38.93 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.33 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  38.26 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  30.99 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  30.28 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  31.75 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  31.19 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  30.28 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  27.27 
 
 		 159 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  31.33 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>