More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2408 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  90.07 
 
 		 282 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  79.43 
 
 		 277 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  80.5 
 
 		 277 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  71.63 
 
 		 292 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  71.63 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  71.99 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  72.34 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  42.26 
 
 		 294 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  36.98 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  34.65 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  35.1 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  32.51 
 
 		 380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.1 
 
 		 425 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  34.82 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.31 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.81 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.42 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.58 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  30.13 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.64 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  32.8 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  27.2 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 		 373 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  32.51 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.16 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.13 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 		 393 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  31.23 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.71 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.71 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  29.2 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.76 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  30.43 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 263 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 254 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.52 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.91 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  26.97 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 		 393 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.57 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 270 aa  96.3  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 		 262 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 262 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.39 
 
 		 256 aa  95.9  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.69 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.45 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>