More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1416 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.780286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.41 
 
 
228 aa  332  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1823  ABC methionine transporter, ATPase subunit MetI  81.94 
 
 
228 aa  331  6e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.21 
 
 
221 aa  204  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.02 
 
 
220 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
222 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.05 
 
 
224 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.05 
 
 
224 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
225 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.37 
 
 
220 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.13 
 
 
219 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
219 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
224 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
222 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
217 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.84 
 
 
219 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.32 
 
 
225 aa  153  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  45.81 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  45.81 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
222 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
235 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 
226 aa  152  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.77 
 
 
218 aa  151  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  46.77 
 
 
218 aa  151  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
224 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  44 
 
 
225 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
235 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  43 
 
 
224 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.79 
 
 
219 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  44.25 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  43.5 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  42.15 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  44.25 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  44.25 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
213 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
222 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0566  ABC transporter integral membrane protein  47.2 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0561  ABC transporter integral membrane protein  47.2 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0620  ABC transporter integral membrane protein  47.2 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0559  ABC transporter integral membrane protein  47.2 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0576  ABC transporter integral membrane protein  47.2 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.332702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  44.24 
 
 
217 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.26 
 
 
219 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
221 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  44.24 
 
 
217 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
217 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  45.81 
 
 
217 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 
221 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 
228 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 
217 aa  141  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  48.31 
 
 
217 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.28 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
217 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 
221 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
217 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
217 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
217 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
217 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  42.86 
 
 
213 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  46.86 
 
 
217 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
221 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
221 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  45.89 
 
 
217 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
218 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4961  ABC transporter, permease protein  43.35 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
230 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0342  ABC transporter, permease protein  42.18 
 
 
221 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.65 
 
 
224 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  40.76 
 
 
218 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.97 
 
 
219 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0298  ABC transporter permease  42.86 
 
 
221 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0285  ABC transporter, permease  42.86 
 
 
221 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0386  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
221 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0313  ABC transporter permease  42.86 
 
 
221 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0344  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
221 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  45.5 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0359  ABC transporter, permease protein  44.13 
 
 
200 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>