261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3108 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  62.03 
 
 		 159 aa  217  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.12 
 
 		 159 aa  214  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.76 
 
 		 159 aa  214  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.03 
 
 		 159 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  62.03 
 
 		 159 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  61.39 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  61.39 
 
 		 159 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  61.39 
 
 		 159 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.49 
 
 		 159 aa  209  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.23 
 
 		 159 aa  203  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.23 
 
 		 159 aa  203  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  56.96 
 
 		 159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.72 
 
 		 159 aa  196  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.27 
 
 		 159 aa  190  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.06 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  53.8 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.08 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.72 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.08 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  48.3 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  45.58 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.08 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.21 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.97 
 
 		 146 aa  147  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.59 
 
 		 145 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.14 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.52 
 
 		 145 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.45 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 		 145 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.17 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  45.14 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.44 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.75 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 		 145 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.69 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.83 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  54.31 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.07 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.78 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  48.59 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  46.48 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.66 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  42.95 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  40 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  45.27 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.38 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  41.89 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 		 149 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  40.28 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 		 149 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 		 153 aa  121  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.07 
 
 		 149 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.38 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.84 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  46.15 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.85 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.93 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  44.76 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.57 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.44 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.32 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  39.04 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.55 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  33.57 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.32 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  33.57 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  52.83 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.13 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.04 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.24 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  40 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.79 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.86 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.43 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.86 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.86 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.86 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.86 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.86 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>