More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0853 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0816  protoheme IX farnesyltransferase  99.32 
 
 		 295 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0839  protoheme IX farnesyltransferase  99.32 
 
 		 295 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0853  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4372  protoheme IX farnesyltransferase  98.64 
 
 		 295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1329  protoheme IX farnesyltransferase  78.57 
 
 		 295 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1145  protoheme IX farnesyltransferase  78.23 
 
 		 295 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4644  protoheme IX farnesyltransferase  78.57 
 
 		 295 aa  474  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0297011  normal  0.149911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1086  protoheme IX farnesyltransferase  66.89 
 
 		 296 aa  404  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000120352  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1039  protoheme IX farnesyltransferase  66.78 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3273  protoheme IX farnesyltransferase  66.78 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2886  protoheme IX farnesyltransferase  65.76 
 
 		 296 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3077  protoheme IX farnesyltransferase  65.76 
 
 		 297 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10772  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  67.38 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  67.38 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0497  protoheme IX farnesyltransferase  67.38 
 
 		 295 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.621665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0958  protoheme IX farnesyltransferase  68.24 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110799  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  67.38 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  67.38 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00379  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.013181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3181  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3205  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0463  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0468  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.259117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0512  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.207916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0503  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.153723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00383  hypothetical protein  66.67 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0198461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0895  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 295 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0350  protoheme IX farnesyltransferase  66.31 
 
 		 296 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3245  protoheme IX farnesyltransferase  65.19 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3102  protoheme IX farnesyltransferase  65.19 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3064  protoheme IX farnesyltransferase  65.19 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1291  protoheme IX farnesyltransferase  65.36 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000335435  hitchhiker  0.00464829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4069  protoheme IX farnesyltransferase  63.29 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47150  protoheme IX farnesyltransferase  63.64 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3827  protoheme IX farnesyltransferase  58.5 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0220  protoheme IX farnesyltransferase  57.84 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3918  protoheme IX farnesyltransferase  58.16 
 
 		 310 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4035  protoheme IX farnesyltransferase  58.5 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3862  protoheme IX farnesyltransferase  58.04 
 
 		 315 aa  340  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367918  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4222  protoheme IX farnesyltransferase  58.74 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4150  protoheme IX farnesyltransferase  58.74 
 
 		 310 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03908  protoheme IX farnesyltransferase  55.82 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1294  protoheme IX farnesyltransferase  59.65 
 
 		 296 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4354  protoheme IX farnesyltransferase  59.07 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0429  protoheme IX farnesyltransferase  56.89 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0093  protoheme IX farnesyltransferase  56.51 
 
 		 296 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0370  protoheme IX farnesyltransferase  56.34 
 
 		 308 aa  315  8e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001557  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  49.3 
 
 		 290 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  47.14 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05495  protoheme IX farnesyltransferase  48.75 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  41.07 
 
 		 308 aa  205  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  37.23 
 
 		 317 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0982  protoheme IX farnesyltransferase  37.93 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  36.43 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  36.47 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  36.8 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2647  protoheme IX farnesyltransferase  35.31 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3771  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.953397  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  34.41 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  35.13 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  36.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  35.13 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1192  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3992  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3857  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00164429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3688  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.583143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3705  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000950979  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4155  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4063  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3960  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4047  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  34.77 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1854  protoheme IX farnesyltransferase  37.15 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  33.69 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  33.69 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  34.88 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 		 535 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  34.46 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  34.08 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  34.21 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  33.83 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  32.74 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  35.34 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  34.28 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  33.08 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  32.62 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  34.75 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  34.96 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  31.54 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>