186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0020 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 94 aa  189  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  74.73 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  74.73 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  63.44 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  61.97 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  59.15 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  48.81 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  47.89 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  47.76 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  42.5 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  45.9 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  44.29 
 
 		 192 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  36.9 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  42.62 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  39.19 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  42.37 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  39.66 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  33.73 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  44.07 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  39.24 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  36.23 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  33.72 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  48.33 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  48.33 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  34.07 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  40.79 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  36.92 
 
 		 196 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  36.76 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  32.05 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  40.26 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  39.34 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  31.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  31.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  39.19 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  31.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  31.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  39.19 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  39.19 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  39.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  31.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  39.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  39.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  39.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  32.95 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 187 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  31.4 
 
 		 192 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 187 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  31.4 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0580  hypothetical protein  46.91 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.471121  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  36.59 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  37.68 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  37.84 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  32.5 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  27.54 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32.86 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  32.86 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  37.84 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  42.62 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>