28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1694 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  702    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  53.26 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  50.85 
 
 		 193 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  28.74 
 
 		 631 aa  105  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 		 581 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1389 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  26.46 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  29.34 
 
 		 788 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  29.34 
 
 		 788 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  29.34 
 
 		 788 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  25.68 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.91 
 
 		 1679 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  28.73 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  28.14 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  27.07 
 
 		 776 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  23.79 
 
 		 763 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  20.53 
 
 		 816 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 		 863 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  25.39 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  28.67 
 
 		 568 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  25.79 
 
 		 603 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  22.36 
 
 		 618 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  22.9 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  30.19 
 
 		 583 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  26.77 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  28.03 
 
 		 545 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  26.28 
 
 		 565 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  27.96 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>