More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0523 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  100 
 
 		 571 aa  1148    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  48.38 
 
 		 613 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  44.58 
 
 		 600 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  42.6 
 
 		 599 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  35.51 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  36.97 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  34.34 
 
 		 600 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  33.87 
 
 		 625 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  35.94 
 
 		 614 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  33.87 
 
 		 605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 		 599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  33.81 
 
 		 628 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  32.98 
 
 		 603 aa  300  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  32.39 
 
 		 594 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  32.98 
 
 		 599 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  34.39 
 
 		 583 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  32.62 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  32.07 
 
 		 552 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  31.46 
 
 		 586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  33.71 
 
 		 568 aa  273  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  32.43 
 
 		 586 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  31.47 
 
 		 596 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  32.07 
 
 		 596 aa  259  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  33.33 
 
 		 611 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  33.03 
 
 		 583 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  33.13 
 
 		 611 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  31 
 
 		 585 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  29.71 
 
 		 612 aa  250  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  29.75 
 
 		 610 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  31.23 
 
 		 610 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.87 
 
 		 564 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  33.27 
 
 		 605 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  28.1 
 
 		 564 aa  233  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  30.89 
 
 		 610 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.51 
 
 		 564 aa  230  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.73 
 
 		 564 aa  230  5e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  27.86 
 
 		 606 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  30.52 
 
 		 626 aa  223  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  30.4 
 
 		 613 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  32.28 
 
 		 585 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  27.83 
 
 		 601 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.12 
 
 		 601 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  28.3 
 
 		 603 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  33.41 
 
 		 612 aa  200  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  32.88 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.58 
 
 		 574 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  28.69 
 
 		 585 aa  195  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.37 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.88 
 
 		 590 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  39.77 
 
 		 580 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.81 
 
 		 594 aa  190  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.19 
 
 		 579 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  39.02 
 
 		 582 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  39.04 
 
 		 574 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.75 
 
 		 592 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.08 
 
 		 727 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.02 
 
 		 625 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  42.79 
 
 		 598 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  42.61 
 
 		 598 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  29.93 
 
 		 596 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  29.89 
 
 		 595 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  36.94 
 
 		 596 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  38.75 
 
 		 649 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.08 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  25.74 
 
 		 607 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  29.61 
 
 		 699 aa  184  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  36.54 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  28.74 
 
 		 676 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.08 
 
 		 586 aa  184  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.08 
 
 		 586 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  27.73 
 
 		 700 aa  183  9.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  26.5 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.71 
 
 		 596 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  30.6 
 
 		 647 aa  182  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  28.31 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  29.96 
 
 		 595 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  27.03 
 
 		 599 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  28.71 
 
 		 613 aa  181  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  30.2 
 
 		 611 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  37.59 
 
 		 624 aa  180  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  27.73 
 
 		 573 aa  180  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  37.99 
 
 		 596 aa  180  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  30 
 
 		 611 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  39.92 
 
 		 582 aa  179  9e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.4 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  30.91 
 
 		 590 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.61 
 
 		 594 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.37 
 
 		 586 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.11 
 
 		 593 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  40 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.99 
 
 		 586 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  30.61 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.72 
 
 		 586 aa  178  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.72 
 
 		 586 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.04 
 
 		 566 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  38.64 
 
 		 565 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 		 600 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.82 
 
 		 589 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  37.59 
 
 		 639 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>