69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2054 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  277  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  51.94 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  44.76 
 
 		 819 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  42.34 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  40.54 
 
 		 412 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  40.54 
 
 		 411 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  40.54 
 
 		 413 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  36.52 
 
 		 479 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  38.97 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  40.18 
 
 		 513 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  38.13 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  38.13 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  36.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  36.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  42.74 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  42.74 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  36.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  36.03 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  37.41 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  35.17 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  38.89 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  38.98 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  38.84 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  37.29 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  37.76 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  37.78 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  37.61 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5315  hypothetical protein  27.2 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  28.35 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4898  hypothetical protein  27.2 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  28 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  28 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  28 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  28 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  34.45 
 
 		 862 aa  53.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5370  hypothetical protein  26.4 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.847309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  31.03 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  28.93 
 
 		 729 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  29.22 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0939  CHRD domain-containing protein  32.88 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5325  hypothetical protein  29.6 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5634  hypothetical protein  29.6 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946842  hitchhiker  0.0000000000653167 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  28.1 
 
 		 652 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  27.82 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  35.25 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  29.05 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  30.08 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  27.56 
 
 		 460 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  29.05 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  32.5 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3749  CHRD domain-containing protein  28.57 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  26.92 
 
 		 460 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  30.14 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  30.14 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  32.35 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>