More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0672 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  66.03 
 
 		 764 aa  949    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  69.71 
 
 		 768 aa  996    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  66.67 
 
 		 770 aa  919    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  66.58 
 
 		 760 aa  925    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  69.08 
 
 		 726 aa  919    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  64.23 
 
 		 782 aa  925    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  65.55 
 
 		 784 aa  915    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  67.16 
 
 		 782 aa  960    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  69.93 
 
 		 784 aa  962    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 764 aa  741    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  67.4 
 
 		 764 aa  923    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  67.76 
 
 		 814 aa  993    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  67.26 
 
 		 773 aa  914    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  64.7 
 
 		 784 aa  922    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  66.53 
 
 		 750 aa  918    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  63.4 
 
 		 808 aa  909    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  67.76 
 
 		 768 aa  994    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  68.09 
 
 		 778 aa  955    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  100 
 
 		 777 aa  1580    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.59 
 
 		 597 aa  392  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  40.03 
 
 		 600 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 598 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 575 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 620 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.33 
 
 		 587 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  36.68 
 
 		 575 aa  379  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.29 
 
 		 597 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.46 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  39.48 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.13 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  37.63 
 
 		 588 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  39.35 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.25 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  35.34 
 
 		 600 aa  364  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.11 
 
 		 580 aa  364  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 594 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.8 
 
 		 577 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.21 
 
 		 614 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  34.83 
 
 		 870 aa  360  6e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.61 
 
 		 581 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.68 
 
 		 578 aa  357  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.68 
 
 		 578 aa  357  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.14 
 
 		 609 aa  356  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.88 
 
 		 617 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.95 
 
 		 597 aa  354  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  38.58 
 
 		 671 aa  353  5e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 		 598 aa  353  5.9999999999999994e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.51 
 
 		 578 aa  353  8e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.03 
 
 		 586 aa  353  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 586 aa  353  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.03 
 
 		 586 aa  353  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 586 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.19 
 
 		 586 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.86 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.36 
 
 		 637 aa  352  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.02 
 
 		 586 aa  351  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.02 
 
 		 586 aa  351  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  35.26 
 
 		 631 aa  350  6e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.71 
 
 		 598 aa  350  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.71 
 
 		 620 aa  350  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.19 
 
 		 637 aa  349  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.25 
 
 		 608 aa  349  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.73 
 
 		 602 aa  349  1e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.43 
 
 		 579 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  32.69 
 
 		 588 aa  348  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 598 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  34.36 
 
 		 636 aa  347  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  39.21 
 
 		 584 aa  347  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 		 586 aa  347  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.81 
 
 		 598 aa  347  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.23 
 
 		 617 aa  347  6e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.86 
 
 		 586 aa  347  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.95 
 
 		 591 aa  346  8.999999999999999e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.47 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.29 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 585 aa  346  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  36.11 
 
 		 594 aa  344  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.13 
 
 		 622 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.67 
 
 		 602 aa  344  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 		 586 aa  343  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  34.79 
 
 		 602 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  35.44 
 
 		 638 aa  343  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 600 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  34.65 
 
 		 640 aa  342  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.62 
 
 		 601 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.88 
 
 		 598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  36.25 
 
 		 601 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  35.57 
 
 		 613 aa  340  5e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  34.22 
 
 		 628 aa  340  5e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  35.84 
 
 		 566 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.88 
 
 		 598 aa  339  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 		 566 aa  339  9e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.71 
 
 		 598 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.71 
 
 		 598 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  36.25 
 
 		 587 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.71 
 
 		 598 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  38.1 
 
 		 598 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 		 571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.89 
 
 		 625 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.86 
 
 		 582 aa  337  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>