35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0237 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  78.95 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  35.71 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  35.71 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  32.35 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  34.86 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  31.51 
 
 		 306 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  32.35 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  32.07 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  34.02 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  30.47 
 
 		 282 aa  92  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  30.93 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  29.96 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  31.91 
 
 		 296 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  32.22 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  29.34 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  28.69 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  29.66 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  31.28 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  26.97 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  27.24 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  29.67 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  26.39 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  25.46 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  25.11 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  25.11 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  24.2 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  25.57 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  27.73 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  25.95 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  24.12 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  24.32 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  24.55 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  24.55 
 
 		 301 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>