More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4698 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  100 
 
 		 368 aa  715    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  78.59 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  32.33 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  41.07 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  40.8 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  34.04 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  36.22 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  44.62 
 
 		 268 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  35.94 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  39.61 
 
 		 324 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  40.52 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  42.75 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  42.96 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.66 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  33.19 
 
 		 272 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  29.39 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  29.39 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  39.29 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  39.86 
 
 		 310 aa  89.4  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  42.28 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  32.73 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  37.72 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  32.84 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  41.12 
 
 		 280 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  42.37 
 
 		 289 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  36.55 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  32.35 
 
 		 301 aa  86.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  37.67 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  37.93 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  39.87 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  45.6 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  37.5 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  28.4 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  44.85 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.17 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  43.22 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  39.35 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  41.53 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  36.81 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.17 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  38.65 
 
 		 529 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.41 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  38.74 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  36.32 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  34.42 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  38.71 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  42.74 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  31.98 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  34.57 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  40.65 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  40.65 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  30.36 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  41.32 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  39.16 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  43.85 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  38.06 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  34.7 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  39.67 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  40.15 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.33 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  36.02 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1670  parB-like partition protein  35.38 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.925128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  38 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.93 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  43.33 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  38.84 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.93 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  31.58 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  46.36 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  37.14 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  39.29 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  38.52 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  36.9 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  33.51 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  36.84 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  46.36 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  41.48 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  32.34 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  32.34 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  36.36 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  30.87 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  32.34 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  32.98 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  39.07 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  32.34 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  38.04 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  33.52 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  31.53 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  38.02 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  32.32 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  37.7 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  34.51 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  39.34 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  33.51 
 
 		 292 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  43.94 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  41.48 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>