171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4505 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4505  transposase  100 
 
 		 220 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  90.91 
 
 		 220 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  90.91 
 
 		 220 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  90.91 
 
 		 220 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  90.91 
 
 		 220 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  64.22 
 
 		 207 aa  288  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  64.68 
 
 		 205 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  62.84 
 
 		 186 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  60.33 
 
 		 187 aa  244  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  55.61 
 
 		 186 aa  231  7.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  54.41 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  51.4 
 
 		 390 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  49.77 
 
 		 375 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  52.22 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  47.03 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  50.8 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  44.23 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  70.59 
 
 		 105 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  51.39 
 
 		 146 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  53.54 
 
 		 171 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  70.45 
 
 		 90 aa  135  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  44.51 
 
 		 172 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  54.37 
 
 		 105 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  74.24 
 
 		 67 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  29.89 
 
 		 376 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  31.69 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  34.23 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0804  hypothetical protein  49.21 
 
 		 64 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  34.23 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  28.8 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  29.94 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  28.41 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  24.84 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  27.89 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  26.99 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  26.98 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  26.98 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  26.98 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  26.98 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  26.98 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  26.98 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  27.63 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  27.27 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  27.27 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28050  transposase  77.14 
 
 		 38 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  27.08 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  30.05 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  30.05 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  26.84 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  25.29 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  31.97 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  31.97 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  31.97 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  26.84 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  26.84 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.83 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  29.8 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.83 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.83 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.83 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  26.83 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  27.81 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  24.14 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  25.79 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  27.81 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  24.44 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  24.44 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  27.81 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  27.81 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  25.6 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  25.6 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  25.6 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  25.15 
 
 		 362 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  25.15 
 
 		 362 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  27.15 
 
 		 353 aa  62  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  26.32 
 
 		 363 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  26.32 
 
 		 363 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  24.44 
 
 		 363 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  24.44 
 
 		 363 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  24.44 
 
 		 363 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  26.32 
 
 		 363 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  23.44 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  24.55 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  24.55 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  24.55 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  24.55 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>