48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3712 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  77.44 
 
 		 136 aa  209  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  53.74 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  61.54 
 
 		 136 aa  153  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  51.82 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  53.06 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  52.7 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  42.75 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  42.31 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  40.71 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  41.67 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  40.91 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  40.8 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  40.8 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  40.8 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  38.03 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  37.91 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  41.6 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  39.2 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  39.2 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  39.57 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  41.04 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  33.87 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  37.06 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  39.29 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  35.61 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  40.16 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  32.56 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  35.83 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  32.89 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  42.39 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  41.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  41.03 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  25.64 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  28.93 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  26.89 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  29.31 
 
 		 147 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  28.93 
 
 		 137 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  26.67 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  26.79 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  27.43 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  27.43 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  28.12 
 
 		 148 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>